Ad oggi la grande differenza sta da una parte nel totale controllo del browser DOM che Javascript e AJAX forniscono e dall’altra nel vantaggio di distribuzione multi-piattaforma e caratteristiche multimediali  che Flash / Flex offre .

Questi due aspetti, che rappresentano i rispettivi punti di forza delle due soluzioni vanno a toccare due temi estremamente caldi:

1. accessibilità ed indicizzazione sui motori di ricerca:
   1.a Flash / Flex: i contenuti testuali vengono letti dal crawler ma si perde il concetto di pagina. In un sito fatto esclusivamente con tecnologia Adobe Flash non si possono fare landing page (questo crea quindi un problema anche sulle campagne Pay Per Click)
   1.b Javascript: il codice generato è HTML. Si hanno quindi a disposizione tutti gli strumenti per avere ottimi risultati sugli aspetti SEO.
2. Browser compatibility
   1.a Flash / Flex: i contenuti vengono visualizzati da un plug-in. Non ci sono quindi particolari problemi cross browser.
   1.b Javascript: esistono diversi problemi di cross browsing dovuti principalmente a bug delle librerie (jQuery, Mootool) e browser che non rispettano gli standard (es. IE6)